中医经典临床研究室为中医临床基础（中医风湿病）研究所的分支机构，主要通过文献数据挖掘、多中心临床回顾性研究、前瞻性队列研究和随机对照研究，筛选并制定免疫性疾病中医治疗方案，并评价其疗效及安全性；同时，利用生物信息学预测有效复方和中药靶标，分析中医药方案的疗效机制，明确中医关键证候的生物学特征。

研究室依托国家重点学科、国家中医药管理局中医痹病学重点学科、浙江省一流学科中医临床基础，获评国家中医药管理局协同创新中心、国家中医药管理局第二批科学研究基地、国家中医药管理局科研三级重点免疫实验室、浙江省中医风湿免疫病重点实验室、浙江省2011免疫性疾病中医诊治协同创新中心。同时为中国科学院大连化学物理研究所代谢组学研究中心浙江分中心，浙江省抗击新冠肺炎疫情先进集体。

研究室目前共有13人，研究员2人、副研究员5人、助理研究员2人，在站博士后4人；博士生导师2人，硕士生导师5人。

本研究室先后承担了国家重点基础研究计划“973计划”项目，国家科技部重点研发计划项目，国家中医药管理局中医药行业专项，国家自然科学基金等国家级项目及省部级科研项目20项余项，获国家科技进步二等奖1项，省部级一等奖4项；发表高质量学术论文200余篇，其中SCI收录70余篇，获授权发明专利8项。